В Томашполі побудовано дерев’яний костьол приблизно у 1748 р. А в 1812 р. розпочато будівництво теперішнього храму. Працю фінансував Чеслав Потоцький. Храм освятив єп. Мацькевіч у 1842 р. В часи репресій в 1936 р. храм був закритий. У ньому влаштовано склад військової одежі, тому як мілітарний об’єкт його на початку війни було спалено. В часі румунської окупації храм був відданий католикам та відремонтований. Черговий раз храм був відібраний у 1950 р. і перебудований. У ньому знаходилися бібліотека та будинок культури. В 1991 році парафіяни відстояли костел, який освятив єп. Ян Ольшанський. У храмі було проведено грунтовний ремонт під керівництвом о. Станіслава Свурки.

У приміщеннях добудованих до храму діє реколекційний будинок, яким опікуються сестри зі світського інституту консекрованого життя Марії Господньої Слугині.