Костел Непорочного Зачаття Пресвятої Діви Марії у Ямполі було споруджено коштом Владислава Добжанського у 1812 р. та консекровано єп. Франциском Мацкевичем, ймовірно, у 20-х роках, якими часто датують будівництво костелу. У другій половині XIX ст. ямпільська парафія налічувала понад 1100 вірян та було збудовано цвинтарну каплицю (деякі дослідники вважають що її спорудженою у XVII ст.). З приходом радянської влади костел закрили, хоча до нього вдалось повернутись під час німецько-румунської окупації в роки ІІ світової війни. Після війни радянська влада знову закрила храм, перетворивши його на склад. Віряни добивались повернення святині, проте її було повністю знищено станом на 1960 рік. Місцеві парафіяни збирались на молитву у приватних будинках, бо навіть колишня цвинтарна каплиця знаходилась у вкрай зруйнованому стані. У 2008 році розпочалось будівництво храму недалеко від місця розташування зруйнованої колишньої святині, причому розпочалось воно не із закладення фундаменту, а з відгородження території, на якій мало проводитись спорудження. Завдяки жертводавцям з Польщі та з Ямполя будівництво та оснащення костелу було завершено у 2017 р. 23 вересня його консекрував єп. Леон Дубравський.